| 序号 | 学院 | 基地名称 | 合作单位 | 专业学位类别/领域 | | 级别 | 批准年份 |
| 1 | 能动 | 上海理工大学动力工程研究生实践基地 | 上海发电设备成套设计研究院、上海工业锅炉研究所 | 动力工程 | 90 | 示范级 | 2015 |
| 2 | 机械 | 上海理工大学车辆工程研究生实践基地 | 上汽集团商用车技术中心、上海汇众汽车制造有限公司、上海纳铁福传动轴有限公司 | 车辆工程 | 200 | 示范级 | 2015 |
| 3 | 医食 | 上海理工大学生物医学工程研究生实践基地 | 微创医疗器械(上海)有限公司 | 生物医学工程、机械工程和光学工程 | 180 | 示范级 | 2017 |
| 4 | 能动 | 上海理工大学动力工程夏普电器实践基地 | 上海夏普电器有限公司 | 动力工程 | 120 | 市级 | 2012 |
| 5 | 能动 | 上海理工大学动力工程专业学位研究生实践基地 | 中国通用机械工业协会冷却设备分会 | 动力工程 | 80 | 市级 | 2018 |
| 6 | 光电 | 上海理工大学工程硕士（控制工程）联合培养基地 | 上海工业自动化仪表研究院 | 控制工程 | 240 | 市级 | 2012 |
| 7 | 光电 | 上海理工大学电气工程研究生实践基地 | 上海电器科学研究院、中国电子科技集团第50研究所上海协同科技股份有限公司 | 电气工程 | 150 | 市级 | 2012 |
| 8 | 光电 | 上海理工大学工程硕士（仪器仪表工程等）联合培养基地 | 上海自动化仪表股份有限公司 | 仪器仪表工程 | 200 | 市级 | 2012 |
| 9 | 光电 | 上海理工大学计算机技术专业学位研究生联合培养实践基地 | 上海计算机软件技术开发中心 | 计算机技术 | 100 | 市级 | 2013 |
| 10 | 光电 | 上海理工大学“光学工程”全日制专业学位研究生联合培养基地 | 上海市计量测试技术研究院 | 光学工程 | 150 | 市级 | 2014 |
| 11 | 管理 | 上海理工大学国际商务联合国贸易网络上海中心实践基地 | 上海市电子商务促进中心（联合国贸易网络上海中心） | 国际商务硕士 | 120 | 市级 | 2012 |
| 12 | 管理 | 上海理工大学公共管理硕士（MPA）研究生温州实践基地 | 温州市发展和改革委员会 | 公共管理硕士 | 90 | 市级 | 2012 |
| 13 | 管理 | 上海理工大学MBA雪浪湖实践基地 | 上海雪浪湖农家乐观光旅游有限公司 | 工商管理硕士 | 200 | 市级 | 2012 |
| 14 | 管理 | 上海理工大学工业工程专业学位研究生联合培养实践基地 | 上海庞源机械租赁股份有限公司 | 工业工程 | 120 | 市级 | 2013 |
| 15 | 机械 | 上海理工大学机械工程研究生实践基地 | 上海材料研究所、上海宝菱冶金设备工程技术有限公司 | 机械工程 | 160 | 市级 | 2012 |
| 16 | 机械 | 上海理工大学机械工程研究生机械设计实践基地 | 上海电气集团股份有限公司中央研究院、上海电动工具研究所 | 机械工程 | 160 | 市级 | 2012 |
| 17 | 外语 | 上海理工大学翻译硕士传神实践基地 | 上海传神翻译服务有限公司 | 翻译硕士 | 600 | 市级 | 2012 |
| 18 | 环建 | 上海理工大学全日制工程硕士绿色建筑环境节能创新创业实践基地 | 上海汽车资产经营有限公司 | 建筑与土木工程、环境工程 | 100 | 市级 | 2012 |
| 19 | 环建 | 上海理工大学土木工程专业学位研究生培养基地 | 上海市建筑科学研究院（集团）有限公司 | 建筑与土木工程 | 200 | 市级 | 2014 |
| 20 | 出版 | 上海理工大学出版硕士实践基地 | 上海张江数字出版文化创意产业发展有限公司（张江国家数字出版基地） | 出版硕士 | 200 | 市级 | 2015 |
| 21 | 能动 | 上海理工大学能源动力工程专业学位研究生实践基地 | 中国科学院上海技术物理研究所 | 动力工程 | 120 | 校级 | 2016 |
| 22 | 能动 | 上海理工大学动力工程专业学位研究生实践基地 | 上海明华电力技术工程有限公司 | 动力工程 | 100 | 校级 | 2016 |
| 23 | 光电 | 上海理工大学控制工程专业学位研究生实践基地 | 上海工业自动化仪表研究院 | 控制工程 | 200 | 校级 | 2016 |
| 24 | 光电 | 上海理工大学光学工程专业学位研究生实践基地 | 上海赛克力光电缆有限责任公司 | 光学工程 | 120 | 校级 | 2016 |
| 25 | 管理 | 上海理工大学交通运输工程专业学位研究生实践基地 | 上海城市交通设计院有限公司 | 交通运输工程 | 120 | 校级 | 2016 |
| 26 | 机械 | 上海理工大学机械工程专业学位研究生实践基地 | 加通汽车内饰（常熟）有限公司 | 机械工程/车辆工程 | 120 | 校级 | 2016 |
| 27 | 环建 | 上海理工大学环境专业学位研究生实践基地 | 上海京明环境科技有限公司 | 环境工程 | 50 | 校级 | 2016 |
| 28 | 医食 | 上海理工大学食品工程专业学位研究生实践基地 | 丰益（上海）生物技术研发中心有限公司 | 食品工程 | 80 | 校级 | 2016 |
| 29 | 外语 | 上理外语-喜沃研究生翻译实践基地 | 上海喜沃文化传播有限公司 | 翻译硕士 | 200 | 校级 | 2016 |
| 30 | 能动 | 上海理工大学动力工程专业学位研究生实践基地 | 上海华谊集团装备工程有限公司 | 动力工程 | 90 | 校级 | 2018 |